円盤生物ノーバ
ウルトラマンメビウス(2006) 第28話『コノミの宝物』
身長：57m
体重：1万t

防衛隊MAC壊滅以降に出現したノーバの別個体。
アーカイブドキュメントの防衛隊が存在しない時代の怪獣を記録した「アウトオブドキュメント」にファイル。
武器は両腕の鞭と鎌、口から吐き出す火炎弾、体を円盤状に変形し高速回転し体当たり。
フェニックスネストに潜入しリムエレキングが実体化するため必要な高エネルギー分子ミストを横取りし夜な夜なフェニックスネスト周辺に出没し「赤い幽霊」騒動を巻き起こす。
分子ミストを利用し作り上げた巨大な囮を駆使しGUYSを誘い出しフェニックスネストの警備が手薄になり本体が出現。メビウスに体力を消耗させるテレポーテーションを使わせ疲労したメビウスを抹殺しようとするなど狡猾でメビウスを追い詰めコノミが召喚したミクラスの援護でメビウスは危機を脱出。メビュームシュートで倒された

マケットノーバ

ノーバがGUYSやメビウスを翻弄するためフェニックスネスト内部で密かに集めた高エネルギー分子ミストを使って作り上げた囮。
口から赤い毒ガスを噴射するが囮として作られたマケットで人間を発狂させる効果はなく出撃したGUYSマシン各機の機能低下。
メビウスが出現した時点で役目を果たしメビウスが戦おうとした瞬間に消滅

無双鉄神インペライザー
ウルトラマンメビウス(2006)第29話『別れの日』､第30話『約束の炎』､第48話『最終三部作I 皇帝の降臨』､第49話『最終三部作II 絶望の暗雲』
身長：60m
体重：6万t

尖兵として地球に送り込まれた。
存在を察知したウルトラの父がメビウスに帰還命令を送るほど高いポテンシャルを秘め代わりに派遣されたタロウによると「地球にこれから訪れる最大の危機の前触れでしかない」。
神出鬼没の空間転移能力に加えタロウのストリウム光線と同等の威力を持つビームを発射する頭部の三連装ガトリングガン、標的を自動的に追尾する赤い光弾を連続発射する両肩の砲門といった強力な武装。上半身を高速回転させ光弾を乱射すると辺りは一瞬で焦土化。メビュームシュートを受けても傷付かず地球上に存在しない未知の金属で作られた強靭な装甲、万が一破損・分解しても内部構造ともども完全復元する自己修復機能。自己修復機能はウルトラダイナマイトを受けバラバラになっても瞬時に再生できる上に腕は切断されても大剣に変化。
第29話で空間転移能力で街中に現れ街を破壊。
メビウスとの戦いで圧倒しエネルギー切れへ追い込むが救援に駆けつけたタロウのストリウム光線を喰らい上半身を吹き飛ばされ状況を不利と見たのか空間転移で行方を眩ます。
第30話で全身を完全修復すると同時に能力強化して再出現。GUYSの作戦を切り抜け再登場したタロウも苦戦させメビウスも戦闘不能に追い込むがGUYSクルーの想いを受けバーニングブレイブとなって復活したメビウスのメビュームバーストを受け再生できないまま完全消滅。
第48話で宇宙から13体が送り込まれ東京､北京､ワシントンD.C.､サンフランシスコ､パリ､ロンドン､モスクワ､シドニー､ボゴタ､ニューデリー､プレトリア､ローマ､カイロといった各国の首都や大都市を襲う。
第49話でGUYS基地を襲う機体のうちの1体が左腕から発射するドリルミサイルがある。
破壊されても別の個体が送り込まれメビウスも苦戦せず撃破しガンフェニックストライカーのインビシブルフェニックス・パワーマキシマムやシルバーシャークGで倒された。残る数体がフェニックスネストを襲撃するがメビウスとGUYSの救援に駆けつけたザムシャーに一刀両断され同じく駆けつけたカコとファントン星人の超能力で押し潰される

円盤生物ロベルガー
ウルトラマンメビウス(2006) 第31話『仲間達の想い』
身長：55m
体重：1万9千t

メビウス抹殺のため地球に飛来。
GUYSスペーシーの監視衛星を破壊し防衛網に穴を開け大量のUFO団と共に地球に飛来。
武器は頭部の単眼と両手から繰り出す光弾。身体能力に優れ格闘戦でメビウスと互角以上に渡り合う。
畳み掛けるような攻撃でメビウスを苦戦させGUYSの援護で勇気付けられバーニングブレイブ形態となったメビウスのメビュームバーストで倒された

宇宙調査員メイツ星人ビオ
ウルトラマンメビウス(2006) 第32話『怪獣使いの遺産』
身長：2.1m
体重：68kg

GUYSのドキュメントMATにデータが記録されるメイツ星人の息子で地球人と和平を結ぶ使者として円盤に乗ってやってきた。父を殺された恨みから深く地球人を憎む。
メビウス＝ミライに「地球とメイツ星の問題に干渉しないで欲しい」と語り平和的解決のため話し合いを行おうとするがミライの身を案じ早まったリュウに腕を撃たれ地球人に対する憎しみを再燃。
賠償として「地球の陸地の20%をメイツ星に譲渡しなければ攻撃を行う」と一方的に交渉を迫るが受け入れられず回答を待とうとさえせず宇宙船とゾアムルチによる攻撃を開始。
ビオの父と共に生活した佐久間少年とかつて出会ったコノミの勤めた保育園の園長の説得、教えを受けた子供たちが見せた優しさに思いとどまるが憎しみ自体は消せず憎しみに忠実に暴れるゾアムルチを倒すことをメビウスに嘆願。
ゾアムルチが倒され自分の行動を悔い改めたリュウとミライに見守られ地球を去る

巨大魚怪獣ゾアムルチ
ウルトラマンメビウス(2006) 第32話『怪獣使いの遺産』
身長：48m
体重：1万t

GUYSのドキュメントMATに記録されるムルチの別個体をビオが攻撃兵器として改良。
地球にやってくる際は冬眠状態で万が一の武力手段として円盤に積まれた。
ムルチで模様であった青い斑点はゾアムルチで青い結晶のようなものとして下半身や尻尾に埋め込まれる。
ビオの脳波に操られ円盤の破壊活動を止めようとしたメビウスに対抗したビオによって覚醒し破壊光線を口から吐きメビウスと戦うがメビウスに胸で受け止められる。
園長とリュウの説得に思い留まったビオの願いを受けメビウスのメビュームシュートを受け倒される

人魂怪獣フェミゴンフレイム
ウルトラマンメビウス(2006) 第33話『青い火の女』
身長：70m
体重：5万t

ドキュメントMATに記録されたフェミゴンの別個体。
本来は人魂のような形の不定形の宇宙生物だが人間の女性に憑依すると怪獣の形を取って実体化。
武器は両目と口から撃ち出す火炎弾。工業地帯のコンビナートを襲撃し爆発で燃え上がる炎を吸収しエネルギーにする。
憑依した宿主との肉体のシンクロ化が深くフェミゴンフレイムを攻撃すると憑依された人間もフェミゴンと同じ場所に傷がつく。
地球上に飛来しテッペイの先輩の妹であるタカムラ・ミサに憑依。
夜に実体化し暴れ攻撃できないGUYSやメビウスも手を焼きテッペイがミライの協力で完成させた新型メテオール「スピリット・セパレーター」の効果でミサから分離させられ消滅。
分離した際ミサはフェミゴンに憑依された時の記憶も消える

光波宇宙人リフレクト星人
ウルトラマンメビウス(2006) 第34話『故郷のない男』
身長：50m
体重：5万5千t

メビウスとGUYSに挑戦。口調は慇懃無礼だが卑劣。
全身が光線の吸収性を全く持たず光学エネルギーを反射。光線技に対し鉄壁の防御力。
両手に装備する棘付きのシールドは攻守両方に優れ中にミサイル弾やチェーン、剣などの多彩な武器が仕込まれ攻撃面も抜かりは無い。
メビウスとの初戦で体質を生かしメビュームシュートやメビュームナイトブレードを反射し圧倒し余裕の態度で撤退。
再戦時メビウスが修行の末に会得した「メビュームスピンキック」でシールドを破壊され逆上。
咄嗟にガンフェニックスを人質に取って優位に立とうとしレオの加勢で形成逆転。
レオのレオキックとメビウスのメビュームスピンキックを受け胴体に大穴を開けられ爆発し倒された

暗黒星人ババルウ星人
ウルトラマンメビウス(2006) 第35話『群青の光と影』
身長：2～56m
体重：140kg～2万8千t

ドミュメントMACに記録が残るババルウ星人の別個体。何者かに尖兵として派遣。
アストラに変身しウルトラ兄弟とレオ兄弟を対立させた元祖ババルウ星人同様に変身能力を有し外見は本物と見分けがつかず前髪をかき上げるクセは残る。
武器は鉄球つきの二股の槍、口から吐く冷凍ブレス。
惑星アーブでヒカリを待ち伏せしヒカリに下僕になるよう要求し拒否され戦闘。
冷凍ブレスでヒカリに勝利したように見えアーブの心と共鳴し「勇者の鎧」を身に着けた新生ツルギに逆転され地球へと逃亡。
地球上でツルギに変身し市街地で破壊活動を行いヒカリの信頼を失墜させようとした。
後を追ったヒカリとの再戦で正体を暴露され新生ツルギのナイトシュートで倒された

ニセ・ハンターナイトツルギ

ババルウ星人がハンターナイトツルギに変身。
外見は本物と全く見分けがつかないがヒカリがメビウスにナイトブレスを譲ったことを知らず腕にナイトブレスをつけたことでミライ＝メビウスに一発で偽者と見抜かれた。
本家ヒカリと同等のナイトシュートやナイトブレードも使う

土塊怪獣アングロス
ウルトラマンメビウス(2006) 第36話『ミライの妹』
身長：43m
体重：3万t

サイコキノ星人カコの超能力で作り出された。
体が鉱物粒子で構成され生命反応を持たない泥人形かゴーレムのような存在。
武器は鼻先についたドリル状の角、凶暴化時に背中から生える3本の角。
ゲーム感覚でメビウスに挑もうとしたサイコキノ星人の超能力で出現しガンフェニックスと戦闘するが形勢不利と見て一時地中に身を隠す。
メビウスと戦うため再び地中から呼び出される。
サイコキノ星人の超能力で動きを封じられたメビウスに大量の土を浴びせ生き埋めにしようとするがコノミが召喚したミクラスの登場でメビウスはピンチを脱しメビウスの説得で心を動かされたサイコキノ星人がメビウスを解放しメビュームシュートで倒された

念動宇宙人サイコキノ星人カコ
ウルトラマンメビウス(2006)　第36話『ミライの妹』、第49話『最終三部作Ⅱ：絶望の暗雲』、第50話『最終三部作Ⅲ：心からの言葉』
身長・体重：人間と同じくらい

メビウスとアングロスの戦闘後に現場近くでミライと出会った。
地球人の中学生の姿だが本来グレイタイプの宇宙人。
発達した超能力を持つが超能力の乱用で母星を失い仲間と宇宙船で宇宙各地を放浪。
一方で仲間たちと共に訪れた星で迷惑な「イタズラ」を行いミステラー星とアテリア星の戦争の悪化、バルダック星の雪害など悪質な行為をゲーム感覚でやっている。
地球で遊び半分でアングロスを念力で操りメビウスに挑む。
「兄弟」という言葉に特別強い思い入れを持つウルトラ一族の心境を利用しミライの妹のカコを名乗りGUYSに保護。
隊員たちの歓迎に複雑な心境を抱きながらも時間を過ごすがカコの超能力でひどい目にあったトリヤマ補佐官がカコを独断で拘束しようとし怒って基地から姿を消す。
ミライにアングロスをけしかけメビウスを追い詰めメビウスの説得に心を動かし戦闘放棄。
「自分たち宇宙人や宇宙怪獣は地球人や感知できない『時空波』に呼び寄せられやってくる」という言葉を残し他の星で悪戯しようと企む仲間を諫め地球を後にした。
地球におけるインペライザーを率いる皇帝エンペラ星人との最終決戦で決死の攻防を繰り広げるGUYSの元へファントン星人やザムシャーらと共に駆けつけフェニックスネストの防衛線を突破しようとしたインペライザーを食い止めテレポートでファントン星人と共にフェニックスネストに姿を見せた

宇宙三面魔像ジャシュライン
ウルトラマンメビウス(2006) 第37話『父の背中』
身長：60m
体重：6万t

時空波に呼び寄せられメビウスに挑戦するため地球を訪れた。
エリダヌス座宇宙の近辺を荒らす悪名高い宇宙のストリートファイターで当人曰く「宇宙ストリートファイト連勝街道驀進中」。自分が倒した相手の死体を黄金の像に変えコレクション。
3兄弟の人格が1つのボディを共有する構造で頭のランプが点灯した顔がその時点の攻撃主導権。
上の怒り面は長兄。一人称は「俺様」で語尾に「～ジャジャ」とつける。腕に装着したブーメラン攻撃が得意。
中央の笑顔は次兄。一人称は「僕ちん」で語尾に「～シュラ」とつける。軽快なフットワークの格闘術が得意。
下の無表情面は末弟。一人称は「わし」で語尾に「～イン」とつける。強力な念力の使い手。
必殺技は三兄弟の頭のランプを全て点灯させ放つ黄金化光線で浴びた相手は瞬時に黄金像へ変える。
メビウスとの初戦でそれぞれの特色を活かした攻撃でメビウスを圧倒しメビウスを黄金化光線で黄金像に変えた。
メビウスの危機を救うため駆けつけたウルトラの父もコレクションに加えると豪語し戦いを挑み翻弄されウルトラの父の力でメビウス復活。
バーニングブレイブと化したメビウスに逆転され地球の地核を刺激し全てを粉々にしようとしメビウスの放ったメビュームバーストを受け粉砕

宇宙有翼怪獣アリゲラ
ウルトラマンメビウス(2006) 第38話『オーシャンの勇魚（イサナ）』
身長：55m
体重：1万1千t

時空波に呼び寄せられ地球に飛来。陸上でも水中でも様々な環境で活発に活動できる広い適応力、戦闘機も凌ぐ機動性と飛行能力。
「視覚」を持たず両肩についている発光するパルス孔から超音波を発し周囲の状況を認識。
パルス孔は電磁ビーム弾を発射、尾の先は敵の追尾能力がある電磁ビーム弾を発射。スパイクつきの両腕の翼は非常に強靭かつ鋭利で巨大な刃物のように扱い接近戦で威力を発揮。
地球に飛来し洋上でGUYS、メビウスと激突。メビウスを負傷させGUYSオーシャンの隊員イサナ・ヒロシの援護攻撃を受け撃墜され日本海溝に避難。
GUYSジャパンとGUYSオーシャンの共同作戦で海底から誘導され房総半島で激突。低空飛行でメビウスに突撃しようとしメビュームブレードで一刀両断

憑依宇宙人サーペント星人
ウルトラマンメビウス(2006) 第39話『無敵のママ』
身長：1.58～48m
体重：48kg～2万4千t

M9球状星雲からGUYS壊滅の為の尖兵。憑依宇宙人の名の通り他者に同化し乗り移る。
フェニックスネストに侵入する為GUYSの社員食堂で働く日ノ出サユリに憑依し突撃部隊をフェニックスネスト内部に誘導、基地のメインシステムを爆破しようとした。
腕の小型銃から電撃光線を発射、複数のサーペント星人が合体すると巨大化。
巨大化時は右手から発射する水色の光線弾が武器。
全身を覆う甲冑はメビュームブレードに耐えるが実は体の90%以上が水分で出来たナメクジのような体質で塩分が苦手。
メビウスと対決し自己再生で攻撃を受けず塩化ナトリウムが主成分の金属火災用消化弾を撃たれ茶色に変色し凝固状態でメビュームブレードで斬られ砂となって崩落

宇宙植物怪人ソリチュラン
ウルトラマンメビウス(2006) 第40話『ひとりの楽園』
身長：1.75m
体重：75kg

ソリチュラの花から生まれた。
白いコートを纏った地球人に擬態し徘徊し孤独や疎外感に陥った人々の心につけこみソリチュラのもとに誘おうとする。
頭の花から麻痺性の花粉を噴射し獲物を捕らえる

宇宙植物怪獣ソリチュラ
ウルトラマンメビウス(2006) 第40話『ひとりの楽園』
身長：50m
体重：2万t

宇宙起源の触手状の生物が地球の樹木と同化。
自らを地球上の全生命体と同化しようと企み地球と同化することが目的。
地球の植物と同化し動けないため体の各部に咲いた花からソリチュランを生み出し操り地球人を次々に自分の元に集めさせた。
集められた人々は人質も同然で攻撃できない。武器は神経麻痺させる花粉、強靭な蔦。
メビウスとの戦いで足元の人々が人質で攻撃できないメビウスを苦しめた。
ガンフェニックスに蔦を切られメビュームブレードの一閃で上半身を切り倒されメビュームシュートを受け炎上

円盤生物ロベルガー二世
ウルトラマンメビウス(2006) 第41話『思い出の先生』
身長：55m
体重：1万9千t

ロベルガーの別個体。
以前と比べ頭の角が増え体のパーツの配色など差異がある。
単眼と両手から繰り出す光弾連射が武器だが身体能力が向上しスピーディな動きで一気に畳み掛ける。
太平洋の無人島に飛来し後を追った80とメビウス相手に戦った。
2大ウルトラ戦士相手に互角に渡り合い80のウルトラレイランスに体を貫かれ怯みメビュームシュートとサクシウム光線を浴び爆散

硫酸怪獣ホー
ウルトラマンメビウス(2006) 第41話『思い出の先生』
身長：50m
体重：2万t

ドキュメントUGMに記録されたホーの別個体。
桜ヶ岡中学校から発生したマイナスエネルギーから誕生し元々実体が無いためレーザー光線が通用しない。
口から破壊光線、両目から硫酸の涙を流す。
メビウスを翻弄。
80の姿を見たホーは喜んで暴れるのを止め抵抗せず80のバックルビームで浄化。
桜ヶ岡中学校が先生として勤務した80こと矢的猛と生徒たちを再会させようとし呼び出したと言われる

宇宙同化獣ガディバ
ウルトラマンメビウス(2006) 第42話『旧友の来訪』、第43話『脅威のメビウスキラー』
身長：不定
体重：不定

黒ずくめの謎の男に操られる。
他の生命体と同化し体を乗っ取るだけでなく自ら同化した生命体の生体情報を完全再現。
ジョンスン島に出現したゴモラ、多々良島に出現したレッドキングと同化しメビウスに挑む。
目的はメビウスとの戦いを通しメビウスの必殺技のデータを取り込みメビウスキラーに転送。
メビウスキラーが粉砕されガディバも粉砕

古代怪獣ゴモラ
ウルトラマンメビウス(2006) 第42話『旧友の来訪』
身長：40m
体重：2万t

ジョンスン島に出現した古代怪獣でドキュメントSSSPに記録されたゴモラの別個体。
一億五千年前に生息した古代恐竜の生き残りで学名「ゴモラザウルス」。
今回のゴモラは怪獣頻出期以降、地球の怪獣が初めて日本以外で確認。
屈強な肉体と強靭な生命力を持ち尻尾を切断されても尻尾も独立し活発に動く。
ガディバに体を完全に同化されレッドキングがメビウスに倒され細胞構造を変化させゴモラの姿になり襲い掛かる。
レッドキングとの戦いでエネルギーを消耗しゴモラと尻尾のダブル攻撃に力尽きそうになるメビウスだが隊員たちの声援に奮起しメビウスバーニングブレイブ形態に変身。
インビンシブルフェニックスとメビュームバーストのダブル攻撃で完全粉砕

どくろ怪獣ﾚｯﾄﾞｷﾝｸﾞ
ウルトラマンメビウス(2006) 第42話『旧友の来訪』
身長：45m
体重：2万t

ドキュメントSSSPとUGMに記録されたレッドキングの別個体。
非常に好戦的で目の前のものに対し誰であろうと戦いを挑む。
ガディバと同化しパワーアップし過去のレッドキングと比べ筋力、瞬発力、強靭性など全ての身体的ステータスが大幅に上回る。
怪力を生かした豪快な肉弾戦、岩石投げが得意技。
持ち上げた岩石を自分の足に落とし痛がり岩山に頭を突っ込み頭をピヨピヨさせるなど凶暴な癖に間抜け。
岩石を次々と放り投げ尻尾と足のバネで空高くジャンプしガンブースターに襲い掛かるなど想像以上の強さを見せる。
メビウスと戦い怪力でメビウスを苦しめ岩山に頭を突っ込みフラフラになりメビュームシュートを受け倒される