巨蛾モスラ
GODZILLA FINAL WARS(2004)
体長：72m
体重：2万5千t

インファント島の守護獣。1万2千年にガイガンと戦い負ける。
羽により相手を突き飛ばす、燃えた体で体当たりという技を持つ。
ゴジラとモンスターXとの戦いの場に出現し改造ガイガンと対決。
ガイガンのチェンソーで羽を斬られ拡散光線を浴び体が燃え上がり体当たりしガイガンの息の根を止めた。
命は助かりインファント島へ帰る

巨大イグアナ ジラ
GODZILLA FINAL WARS(2004)
身長：90m

俊敏。得意技はジャンプし相手に蹴り。マグロが好物。
シドニーでゴジラと対決。ゴジラの熱戦をジャンプで避けキックを繰り出そうとしジャンプし尻尾で叩き落とされオペラハウスに落下し放射熱線で爆発、絶命

サイボーグ怪獣ガイガン
GODZILLA FINAL WARS(2004)
身長：120m
体重：6万t

X星人が操る機械と生物が合成。
1万2千年前にモスラを倒し海底でミイラ化し眠る。
武器は頭部から放つ拡散光線、両手の鎌と腹部の回転鋸。マッハ3で飛行。
地球防衛軍のドッグで目を覚まし新・轟天号を追い南極まで行くがゴジラと対決。
頭部に放射熱線を受け倒れX星人の改造で改造ガイガンとして復活

サイボーグ怪獣 改造ガイガン
GODZILLA FINAL WARS(2004)
身長：120m
体重：6万t

ゴジラに倒されたガイガンが改造・復活。
頭部に装甲が付き両手は巨大チェンソー。胸から回転鋸を放つ。腹部のカッターは健在で頭部から放つ拡散光線は威力が増強。尻尾で相手を掴み投げ飛ばす。
X星人にモスラを退治するため送り込まれた。
拡散光線でモスラを燃やし自分が飛ばした回転鋸が戻ってきて頭部が切断。
モスラが体を燃えたまま体当たりを浴びせ爆散

宇宙超怪獣モンスターX
GODZILLA FINAL WARS(2004)
身長：120m
体重：6万t

X星人が地球に飛ばした「妖星ゴラス」に潜む。ゴジラがゴラスを破壊すると姿を現す。
両肩に目があり全ての目から引力光線を放つ。
ゴジラに身軽な体を生かした格闘技で挑み引力光線とゴジラの熱線の一騎打ちの後カイザーギドラへ変貌

超ドラゴン宇宙怪獣カイザーギドラ
GODZILLA FINAL WARS(2004)
身長：140m
体重：10万t

モンスターXの真の姿。ゴジラと最終決戦の中、突如として変貌。
それぞれの口から反重力光線を放ち相手を宙に上げ投げ飛ばす。敵にかみつきｴﾈﾙｷﾞｰを吸い取る。
ゴジラを圧倒し新・轟天号のG粒子メーサー砲を浴び強力になったゴジラに首二つ破壊されバーニングGスパーク熱線を浴び爆散

X星人
GODZILLA FINAL WARS(2004)

地球人のミトコンドリアを狙い地球侵略を計画。
本来の星や自分たちの言語は地球人に発音しづらい名前で仮称としてX星人と名乗る。
細胞にM塩基を持つ怪獣を世界各地に送り自ら消滅させ地球の味方を装う

怪獣王ゴジラ
シン・ゴジラ
身長：118.5m
体重：9万2千t

太古の時代より生き残った深海棲の海洋生物が60年前に投棄された放射性廃棄物を大量摂取し放射能に耐性が付き突然変異と異常成長を繰り返し誕生。
アメリカのｴﾈﾙｷﾞｰ省で以前から生物の存在を把握し同国の生物調査機関に属した牧悟郎元教授が中心となって生態の研究が進められ彼の故郷である大戸島の伝承にある神の化身「呉爾羅（ごじら）」の名から「GODZILLA」という英語名が与えられた。
日本政府は「巨大不明生物」と呼称し牧の情報を入手以降は日本語訳した「ゴジラ」の通称も用いる。
身体に人間の約8倍という膨大な量の遺伝子情報が内包され爬虫類のみならず魚類や鳥類などといった他の種類に属する生物の性質も多数含まれ世代交代を経ない単一の個体であらゆる環境に対する適応進化。必要に応じ自己退化能力も有し自由に進化・退化、細胞分裂による無性生殖も可能と分析され放置すれば「自己増殖による無制限の繁殖」「有翼化しての飛行能力の獲得による世界規模のテリトリー拡大」「小型化への変異」といった危険性についても言及。
体内に生体原子炉ともいえる「熱核ｴﾈﾙｷﾞｰ変換生体器官」を持つ。生み出されるｴﾈﾙｷﾞｰは莫大で超高温の体温を保つ表皮の一部から高熱によって生じた赤い光が漏出。活動の際に未知の放射性元素を撒き散らす。細胞に元素変換を行える機能を有し体内に取り込んだ水と空気の反応だけで自身の生存に必要なｴﾈﾙｷﾞｰをすべて引き出し他の栄養素を摂取する必要が一切ないと推測され口腔は牙が不揃いで下顎に舌もなく生物の捕食に適さない。
自然界に天敵は存在せず従来の生物的常識を超越した性質は「完全生物」や「霞を食べて生きる仙人」に例えられ生物に不可避の「死」という概念すら克服。
熱ｴﾈﾙｷﾞｰの冷却に血液流による液体冷却と背びれからの放熱を用いる、後者は補助的で血液の循環に問題が発生した場合は熱の冷却が追いつかず原子炉スクラムのような状態となってｴﾈﾙｷﾞｰ生成器官の機能が停止し全身凍結。
矢口蘭堂が率いる日本政府の巨大不明生物災害対策本部（巨災対）は特性を利用し大量の血液凝固剤を直接口から注入しゴジラを封じ込める「矢口プラン」を提唱し自衛隊に実行を移すべく立案された「ヤシオリ作戦」を以てゴジラに臨んだ結果、凍結

透明人間
透明人間（1954）

戦時中、西崎博士はサイクロトロンにより「リンの放射性同位体に対する陽子の連続衝撃実験」を行った。偶然発見した粒子「ホストン」を吸収し可視光線を完全透過するようになった人間。
太平洋戦争末期、透明人間で編成される特攻隊がサイパン島で玉砕したが実は2人が生き残る。
ホストンの効果は元に戻せず透明人間化した者は死なないかぎり目視できない